Сокотра остается одним из лучше всего сохраненных субтропических островов в мире, с большинством его сред обитания, все еще относительно неповрежденных людьми и с небольшим количеством введенных животных. Однако растущее население и индустриализация острова, а также развитие туризма оказывают давление на растительность через вырубку леса, выбивание пастбищ и развитие инфраструктуры. Драконово дерево все еще относительно широко распространено, но его диапазон стал уменьшаться в последнее время, и стал более фрагментированным, а также многие области посадок страдают от плохой регенерации.

Хотя человеческое воздействие, возможно, способствовало этому снижению через выбивание пастбищ и сбор цветов и фруктов для домашнего скота, главная угроза эндемичным разновидностям, как считают ученые, происходит от постепенного высыхания островов Архипелага Сокотры, процесса, который продолжается в течение последних нескольких сотен лет, но который может быть усилен глобальным изменением климата. Во многих случаях деревья не в состоянии цвести, и степень и продолжительность тумана, и облаков, принесенных муссонами, кажется, уменьшается. Увеличение засушливости вызовет 45-процентное сокращение доступной среды обитания для этой разновидности к 2080 году.

Другие потенциальные угрозы драконовому дереву, такие как сбор его смолы и использование его листьев, чтобы сделать веревку, уменьшились в последние годы и являются в настоящее время незначительными, но любое увеличение этих процессов могло потенциально привести к очень быстрому уничтожению дерева.