Животный мир острова представляется, на первый взгляд, довольно скупо, однако у него есть свои загадки. Низшие виды населяемых Сокотру животных, такие как змеи, ящерицы, моллюски, скорпионы и летучие мыши, очень схожи с их дальними родственниками Африки, Полинезии и Азии.
На острове Сокотра также можно увидеть гигантскую стоножку длиной 25-30 см. Каждая нога этого насекомого очень ядовита. Здесь обитает и фитамэ – крупный ядовитый паук.
Сокотру населяет множество гадюк и южноаравийских кобр. Здесь есть довольно редкая змея красноватого цвета из семейства полозов.
Единственными представителями диких животных сокотрийской фауны являются дикий осёл, козёл и «мускусный кот».

«Мускусный кот» – наиболее интересный персонаж из этих млекопитающих. Главная особенностью данного животного – ароматический мускус, вырабатывающийся особыми железами, которые расположены под хвостом. Этот мускус используют для изготовления местной косметики и парфюмерии. Женщины Сокотры натирают мускусным маслом тело и лицо.
Прибрежные воды острова очень богаты рыбой.
Морскую фауну населяют акулы, ядовитые морские змеи, огромные лангусты, креветки, омары и крабы.